پژوهشکده نوین شهر معنوی ثامن در گروه های پژوهشی زیر مشغول به فعالیت می باشد: معماری و شهرسازی, ICT و هوشمندسازی شهری, فرهنگی- اجتماعی (و زیارت), اقتصاد شهری. اهداف:فعالیت های مؤثر در عرصه نهضت نرم افزاری و تولید علم و فن آوری در حوزه شهر نوین معنوی و اسلامی و دستیابی به علوم و فناوری های نوین .تأکید بر دو وجه اصلی معنویت و فناوری های نوین و رسیدن به هوشمند شهر معنوی به عنوان هدف آرمانی و غایی.شناسایی نیازهای بنیادین، کاربردی و توسعه ای مورد نیاز در حوزه مدیریت شهری و زمینه سازی مناسب برای ارتقای فعالیت های پژوهشی، مدیریت دانش، جامعه اطلاعاتی، علوم و فناوری اطلاعات و نوآوری